Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rfx2P48379 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx2P48379 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx2P48379 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx2P48379 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx2P48379 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx2P48379 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx2P48379 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx2P48379 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx2P48379 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rfx2P48379 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx2P48379 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx2P48379 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rfx2P48379 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rfx2P48379 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx2P48379 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx2P48379 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx2P48379 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx2P48379 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx2P48379 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rfx2P48379 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rfx2P48379 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rfx2P48379 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rfx2P48379 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx2P48379 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx2P48379 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx2P48379 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx2P48379 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx2P48379 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx2P48379 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx2P48379 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rfx2P48379 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rfx2P48379 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx2P48379 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rfx2P48379 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx2P48379 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rfx2P48379 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rfx2P48379 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rfx2P48379 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx2P48379 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rfx2P48379 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rfx2P48379 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rfx2P48379 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rfx2P48379 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rfx2P48379 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx2P48379 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx2P48379 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx2P48379 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx2P48379 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx2P48379 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx2P48379 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx2P48379 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx2P48379 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfx2P48379 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx2P48379 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx2P48379 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx2P48379 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx2P48379 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rfx2P48379 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rfx2P48379 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx2P48379 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx2P48379 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfx2P48379 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rfx2P48379 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx2P48379 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx2P48379 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx2P48379 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfx2P48379 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rfx2P48379 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rfx2P48379 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rfx2P48379 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rfx2P48379 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rfx2P48379 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rfx2P48379 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rfx2P48379 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx2P48379 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rfx2P48379 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rfx2P48379 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rfx2P48379 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx2P48379 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx2P48379 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rfx2P48379 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms