Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VdrP48281 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VdrP48281 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VdrP48281 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VdrP48281 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VdrP48281 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
VdrP48281 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VdrP48281 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VdrP48281 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VdrP48281 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VdrP48281 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VdrP48281 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VdrP48281 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VdrP48281 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VdrP48281 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VdrP48281 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VdrP48281 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VdrP48281 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VdrP48281 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VdrP48281 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VdrP48281 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VdrP48281 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VdrP48281 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VdrP48281 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VdrP48281 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VdrP48281 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VdrP48281 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VdrP48281 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VdrP48281 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VdrP48281 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VdrP48281 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VdrP48281 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VdrP48281 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VdrP48281 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VdrP48281 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VdrP48281 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VdrP48281 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VdrP48281 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VdrP48281 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VdrP48281 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VdrP48281 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VdrP48281 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VdrP48281 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VdrP48281 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VdrP48281 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VdrP48281 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VdrP48281 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VdrP48281 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VdrP48281 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VdrP48281 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VdrP48281 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VdrP48281 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VdrP48281 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VdrP48281 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VdrP48281 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VdrP48281 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VdrP48281 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VdrP48281 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VdrP48281 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VdrP48281 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VdrP48281 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VdrP48281 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VdrP48281 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VdrP48281 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VdrP48281 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VdrP48281 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VdrP48281 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VdrP48281 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VdrP48281 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VdrP48281 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VdrP48281 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VdrP48281 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VdrP48281 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VdrP48281 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VdrP48281 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VdrP48281 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VdrP48281 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VdrP48281 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VdrP48281 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VdrP48281 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VdrP48281 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VdrP48281 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VdrP48281 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VdrP48281 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VdrP48281 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VdrP48281 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VdrP48281 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VdrP48281 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VdrP48281 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VdrP48281 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VdrP48281 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VdrP48281 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VdrP48281 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VdrP48281 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VdrP48281 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VdrP48281 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VdrP48281 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VdrP48281 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VdrP48281 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VdrP48281 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms