Protein–RNA interactions for Protein: P47876

Igfbp1, Insulin-like growth factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp1P47876 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igfbp1P47876 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igfbp1P47876 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igfbp1P47876 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igfbp1P47876 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igfbp1P47876 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igfbp1P47876 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igfbp1P47876 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Igfbp1P47876 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igfbp1P47876 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Igfbp1P47876 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igfbp1P47876 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Igfbp1P47876 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Igfbp1P47876 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igfbp1P47876 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Igfbp1P47876 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igfbp1P47876 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igfbp1P47876 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igfbp1P47876 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Igfbp1P47876 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igfbp1P47876 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igfbp1P47876 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igfbp1P47876 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igfbp1P47876 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igfbp1P47876 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igfbp1P47876 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igfbp1P47876 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp1P47876 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igfbp1P47876 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igfbp1P47876 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp1P47876 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igfbp1P47876 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp1P47876 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp1P47876 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp1P47876 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Igfbp1P47876 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Igfbp1P47876 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Igfbp1P47876 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Igfbp1P47876 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igfbp1P47876 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Igfbp1P47876 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms