Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gfpt1P47856 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gfpt1P47856 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gfpt1P47856 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Gfpt1P47856 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gfpt1P47856 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gfpt1P47856 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gfpt1P47856 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gfpt1P47856 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gfpt1P47856 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gfpt1P47856 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gfpt1P47856 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gfpt1P47856 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gfpt1P47856 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gfpt1P47856 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Gfpt1P47856 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gfpt1P47856 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gfpt1P47856 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gfpt1P47856 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gfpt1P47856 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gfpt1P47856 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gfpt1P47856 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gfpt1P47856 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gfpt1P47856 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gfpt1P47856 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gfpt1P47856 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gfpt1P47856 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gfpt1P47856 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gfpt1P47856 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gfpt1P47856 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gfpt1P47856 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Gfpt1P47856 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gfpt1P47856 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gfpt1P47856 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gfpt1P47856 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gfpt1P47856 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gfpt1P47856 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gfpt1P47856 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gfpt1P47856 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gfpt1P47856 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gfpt1P47856 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gfpt1P47856 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gfpt1P47856 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gfpt1P47856 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gfpt1P47856 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gfpt1P47856 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gfpt1P47856 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gfpt1P47856 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gfpt1P47856 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gfpt1P47856 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gfpt1P47856 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gfpt1P47856 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gfpt1P47856 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gfpt1P47856 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gfpt1P47856 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gfpt1P47856 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gfpt1P47856 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gfpt1P47856 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gfpt1P47856 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gfpt1P47856 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gfpt1P47856 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gfpt1P47856 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gfpt1P47856 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gfpt1P47856 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gfpt1P47856 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gfpt1P47856 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gfpt1P47856 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gfpt1P47856 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gfpt1P47856 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gfpt1P47856 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gfpt1P47856 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Gfpt1P47856 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gfpt1P47856 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gfpt1P47856 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gfpt1P47856 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gfpt1P47856 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gfpt1P47856 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gfpt1P47856 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gfpt1P47856 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gfpt1P47856 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gfpt1P47856 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gfpt1P47856 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gfpt1P47856 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gfpt1P47856 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gfpt1P47856 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gfpt1P47856 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gfpt1P47856 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gfpt1P47856 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gfpt1P47856 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms