Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gfpt1P47856 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Gfpt1P47856 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gfpt1P47856 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Gfpt1P47856 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gfpt1P47856 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gfpt1P47856 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gfpt1P47856 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gfpt1P47856 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Gfpt1P47856 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gfpt1P47856 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gfpt1P47856 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Gfpt1P47856 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gfpt1P47856 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gfpt1P47856 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Gfpt1P47856 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gfpt1P47856 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gfpt1P47856 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gfpt1P47856 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gfpt1P47856 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gfpt1P47856 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gfpt1P47856 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gfpt1P47856 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,39■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gfpt1P47856 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Gfpt1P47856 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gfpt1P47856 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gfpt1P47856 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gfpt1P47856 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gfpt1P47856 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gfpt1P47856 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Gfpt1P47856 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Gfpt1P47856 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gfpt1P47856 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Gfpt1P47856 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gfpt1P47856 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Gfpt1P47856 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Gfpt1P47856 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Gfpt1P47856 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Gfpt1P47856 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Gfpt1P47856 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Gfpt1P47856 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Gfpt1P47856 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gfpt1P47856 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gfpt1P47856 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Gfpt1P47856 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Gfpt1P47856 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Gfpt1P47856 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gfpt1P47856 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Gfpt1P47856 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Gfpt1P47856 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Gfpt1P47856 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Gfpt1P47856 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Gfpt1P47856 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gfpt1P47856 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Gfpt1P47856 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Gfpt1P47856 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Gfpt1P47856 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Gfpt1P47856 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Gfpt1P47856 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Gfpt1P47856 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Gfpt1P47856 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gfpt1P47856 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Gfpt1P47856 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Gfpt1P47856 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gfpt1P47856 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Gfpt1P47856 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Gfpt1P47856 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gfpt1P47856 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gfpt1P47856 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gfpt1P47856 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gfpt1P47856 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,39■■■□□ 2,29
Gfpt1P47856 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gfpt1P47856 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gfpt1P47856 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gfpt1P47856 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Gfpt1P47856 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gfpt1P47856 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gfpt1P47856 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gfpt1P47856 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gfpt1P47856 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gfpt1P47856 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gfpt1P47856 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gfpt1P47856 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gfpt1P47856 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gfpt1P47856 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gfpt1P47856 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gfpt1P47856 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms