Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tulp2P46686 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tulp2P46686 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tulp2P46686 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tulp2P46686 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tulp2P46686 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Tulp2P46686 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Tulp2P46686 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Tulp2P46686 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tulp2P46686 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tulp2P46686 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tulp2P46686 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tulp2P46686 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tulp2P46686 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tulp2P46686 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Tulp2P46686 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tulp2P46686 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tulp2P46686 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tulp2P46686 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tulp2P46686 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tulp2P46686 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp2P46686 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp2P46686 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Tulp2P46686 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tulp2P46686 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tulp2P46686 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tulp2P46686 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tulp2P46686 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tulp2P46686 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tulp2P46686 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tulp2P46686 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tulp2P46686 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tulp2P46686 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tulp2P46686 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tulp2P46686 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tulp2P46686 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tulp2P46686 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tulp2P46686 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tulp2P46686 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tulp2P46686 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tulp2P46686 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tulp2P46686 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Tulp2P46686 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tulp2P46686 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tulp2P46686 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tulp2P46686 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tulp2P46686 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tulp2P46686 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tulp2P46686 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tulp2P46686 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tulp2P46686 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tulp2P46686 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tulp2P46686 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tulp2P46686 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tulp2P46686 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tulp2P46686 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tulp2P46686 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tulp2P46686 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tulp2P46686 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tulp2P46686 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tulp2P46686 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tulp2P46686 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tulp2P46686 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tulp2P46686 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tulp2P46686 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tulp2P46686 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tulp2P46686 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tulp2P46686 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tulp2P46686 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tulp2P46686 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tulp2P46686 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tulp2P46686 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tulp2P46686 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tulp2P46686 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tulp2P46686 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tulp2P46686 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tulp2P46686 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tulp2P46686 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tulp2P46686 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms