Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Gdf6P43028 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Gdf6P43028 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Gdf6P43028 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gdf6P43028 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Gdf6P43028 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Gdf6P43028 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Gdf6P43028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Gdf6P43028 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gdf6P43028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gdf6P43028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gdf6P43028 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Gdf6P43028 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Gdf6P43028 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Gdf6P43028 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Gdf6P43028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Gdf6P43028 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Gdf6P43028 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gdf6P43028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gdf6P43028 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gdf6P43028 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gdf6P43028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Gdf6P43028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gdf6P43028 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gdf6P43028 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gdf6P43028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gdf6P43028 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gdf6P43028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gdf6P43028 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gdf6P43028 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gdf6P43028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gdf6P43028 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gdf6P43028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gdf6P43028 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gdf6P43028 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gdf6P43028 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Gdf6P43028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gdf6P43028 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gdf6P43028 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gdf6P43028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Gdf6P43028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gdf6P43028 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Gdf6P43028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Gdf6P43028 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Gdf6P43028 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gdf6P43028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gdf6P43028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gdf6P43028 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Gdf6P43028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gdf6P43028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Gdf6P43028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gdf6P43028 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gdf6P43028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Gdf6P43028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Gdf6P43028 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gdf6P43028 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Gdf6P43028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gdf6P43028 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gdf6P43028 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Gdf6P43028 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gdf6P43028 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gdf6P43028 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gdf6P43028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gdf6P43028 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gdf6P43028 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gdf6P43028 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gdf6P43028 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gdf6P43028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gdf6P43028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gdf6P43028 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Gdf6P43028 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gdf6P43028 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Gdf6P43028 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gdf6P43028 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gdf6P43028 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gdf6P43028 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms