Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sept1P42209 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Sept1P42209 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Sept1P42209 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Sept1P42209 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Sept1P42209 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Sept1P42209 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Sept1P42209 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Sept1P42209 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Sept1P42209 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Sept1P42209 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Sept1P42209 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Sept1P42209 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Sept1P42209 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Sept1P42209 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,8■■■■□ 3
Sept1P42209 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Sept1P42209 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Sept1P42209 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Sept1P42209 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Sept1P42209 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Sept1P42209 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Sept1P42209 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Sept1P42209 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Sept1P42209 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sept1P42209 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sept1P42209 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Sept1P42209 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Sept1P42209 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,45■■■□□ 2,95
Sept1P42209 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Sept1P42209 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Sept1P42209 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Sept1P42209 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Sept1P42209 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Sept1P42209 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Sept1P42209 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Sept1P42209 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sept1P42209 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sept1P42209 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Sept1P42209 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Sept1P42209 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sept1P42209 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sept1P42209 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Sept1P42209 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Sept1P42209 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sept1P42209 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sept1P42209 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Sept1P42209 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sept1P42209 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sept1P42209 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Sept1P42209 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Sept1P42209 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Sept1P42209 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sept1P42209 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sept1P42209 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Sept1P42209 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Sept1P42209 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
Sept1P42209 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Sept1P42209 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Sept1P42209 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Sept1P42209 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Sept1P42209 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Sept1P42209 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Sept1P42209 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Sept1P42209 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Sept1P42209 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Sept1P42209 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sept1P42209 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sept1P42209 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Sept1P42209 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Sept1P42209 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Sept1P42209 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Sept1P42209 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Sept1P42209 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Sept1P42209 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Sept1P42209 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Sept1P42209 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Sept1P42209 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Sept1P42209 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Sept1P42209 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Sept1P42209 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Sept1P42209 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms