Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sar1aP36536 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sar1aP36536 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sar1aP36536 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sar1aP36536 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sar1aP36536 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sar1aP36536 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sar1aP36536 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sar1aP36536 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sar1aP36536 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sar1aP36536 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sar1aP36536 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sar1aP36536 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sar1aP36536 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sar1aP36536 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sar1aP36536 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sar1aP36536 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sar1aP36536 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sar1aP36536 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sar1aP36536 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sar1aP36536 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sar1aP36536 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sar1aP36536 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Sar1aP36536 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sar1aP36536 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sar1aP36536 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sar1aP36536 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sar1aP36536 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sar1aP36536 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sar1aP36536 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sar1aP36536 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sar1aP36536 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sar1aP36536 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sar1aP36536 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sar1aP36536 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sar1aP36536 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sar1aP36536 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sar1aP36536 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sar1aP36536 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sar1aP36536 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sar1aP36536 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sar1aP36536 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sar1aP36536 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sar1aP36536 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sar1aP36536 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sar1aP36536 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sar1aP36536 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sar1aP36536 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sar1aP36536 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sar1aP36536 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sar1aP36536 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sar1aP36536 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sar1aP36536 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sar1aP36536 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sar1aP36536 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sar1aP36536 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sar1aP36536 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms