Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rab19P35294 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rab19P35294 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rab19P35294 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rab19P35294 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab19P35294 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab19P35294 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rab19P35294 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rab19P35294 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rab19P35294 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Rab19P35294 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rab19P35294 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rab19P35294 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab19P35294 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab19P35294 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab19P35294 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab19P35294 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab19P35294 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab19P35294 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab19P35294 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab19P35294 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab19P35294 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab19P35294 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab19P35294 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab19P35294 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Rab19P35294 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab19P35294 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab19P35294 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab19P35294 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab19P35294 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab19P35294 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rab19P35294 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab19P35294 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Rab19P35294 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab19P35294 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab19P35294 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,28■■□□□ 1
Rab19P35294 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Rab19P35294 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Rab19P35294 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Rab19P35294 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rab19P35294 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rab19P35294 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rab19P35294 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rab19P35294 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Rab19P35294 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rab19P35294 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rab19P35294 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab19P35294 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,95
Rab19P35294 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rab19P35294 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rab19P35294 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Rab19P35294 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab19P35294 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab19P35294 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rab19P35294 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,9 ms