Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab19P35294 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab19P35294 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab19P35294 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab19P35294 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab19P35294 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab19P35294 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab19P35294 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab19P35294 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab19P35294 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab19P35294 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab19P35294 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab19P35294 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab19P35294 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab19P35294 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab19P35294 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab19P35294 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab19P35294 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab19P35294 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab19P35294 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab19P35294 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab19P35294 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab19P35294 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab19P35294 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab19P35294 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab19P35294 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab19P35294 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab19P35294 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab19P35294 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab19P35294 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab19P35294 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab19P35294 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab19P35294 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab19P35294 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab19P35294 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab19P35294 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab19P35294 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab19P35294 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab19P35294 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab19P35294 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab19P35294 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab19P35294 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab19P35294 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab19P35294 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab19P35294 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab19P35294 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab19P35294 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab19P35294 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rab19P35294 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab19P35294 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab19P35294 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab19P35294 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab19P35294 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab19P35294 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab19P35294 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms