Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab23P35288 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab23P35288 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab23P35288 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab23P35288 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab23P35288 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab23P35288 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab23P35288 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab23P35288 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab23P35288 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab23P35288 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab23P35288 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab23P35288 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab23P35288 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab23P35288 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab23P35288 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab23P35288 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab23P35288 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab23P35288 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab23P35288 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab23P35288 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab23P35288 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab23P35288 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rab23P35288 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab23P35288 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rab23P35288 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab23P35288 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab23P35288 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab23P35288 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab23P35288 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab23P35288 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab23P35288 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab23P35288 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab23P35288 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab23P35288 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab23P35288 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab23P35288 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab23P35288 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab23P35288 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab23P35288 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab23P35288 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab23P35288 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab23P35288 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab23P35288 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab23P35288 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab23P35288 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab23P35288 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab23P35288 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab23P35288 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab23P35288 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab23P35288 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab23P35288 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab23P35288 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab23P35288 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab23P35288 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab23P35288 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab23P35288 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab23P35288 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab23P35288 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab23P35288 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab23P35288 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab23P35288 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab23P35288 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab23P35288 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab23P35288 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab23P35288 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab23P35288 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab23P35288 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab23P35288 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab23P35288 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab23P35288 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab23P35288 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab23P35288 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab23P35288 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab23P35288 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab23P35288 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab23P35288 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab23P35288 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab23P35288 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms