Protein–RNA interactions for Protein: P35230

Reg3b, Regenerating islet-derived protein 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3bP35230 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Reg3bP35230 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,62
Reg3bP35230 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18,89■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Reg3bP35230 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,83■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Reg3bP35230 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Reg3bP35230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,72■□□□□ 0,59
Reg3bP35230 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Reg3bP35230 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18,7■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18,68■□□□□ 0,58
Reg3bP35230 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Reg3bP35230 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,61■□□□□ 0,57
Reg3bP35230 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18,61■□□□□ 0,57
Reg3bP35230 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Reg3bP35230 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,58■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,57■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
Reg3bP35230 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18,51■□□□□ 0,55
Reg3bP35230 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,5■□□□□ 0,55
Reg3bP35230 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Reg3bP35230 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Reg3bP35230 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18,45■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18,44■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18,41■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,4■□□□□ 0,54
Reg3bP35230 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18,39■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18,39■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18,34■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Reg3bP35230 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18,33■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18,27■□□□□ 0,52
Reg3bP35230 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Reg3bP35230 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Reg3bP35230 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Reg3bP35230 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Reg3bP35230 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Reg3bP35230 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Reg3bP35230 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Reg3bP35230 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Reg3bP35230 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18,14■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Reg3bP35230 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18,08■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Reg3bP35230 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Reg3bP35230 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Reg3bP35230 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Reg3bP35230 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Reg3bP35230 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Reg3bP35230 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Reg3bP35230 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms