Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Ifnar1P33896 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Ifnar1P33896 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Ifnar1P33896 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Ifnar1P33896 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ifnar1P33896 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Ifnar1P33896 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Ifnar1P33896 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Ifnar1P33896 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Ifnar1P33896 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ifnar1P33896 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ifnar1P33896 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ifnar1P33896 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Ifnar1P33896 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Ifnar1P33896 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ifnar1P33896 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ifnar1P33896 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ifnar1P33896 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ifnar1P33896 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Ifnar1P33896 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ifnar1P33896 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Ifnar1P33896 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Ifnar1P33896 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Ifnar1P33896 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ifnar1P33896 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ifnar1P33896 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ifnar1P33896 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ifnar1P33896 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ifnar1P33896 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Ifnar1P33896 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ifnar1P33896 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ifnar1P33896 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ifnar1P33896 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ifnar1P33896 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ifnar1P33896 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ifnar1P33896 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ifnar1P33896 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ifnar1P33896 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ifnar1P33896 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ifnar1P33896 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ifnar1P33896 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ifnar1P33896 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ifnar1P33896 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ifnar1P33896 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ifnar1P33896 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ifnar1P33896 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ifnar1P33896 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ifnar1P33896 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ifnar1P33896 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Ifnar1P33896 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ifnar1P33896 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ifnar1P33896 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ifnar1P33896 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ifnar1P33896 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ifnar1P33896 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ifnar1P33896 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ifnar1P33896 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ifnar1P33896 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ifnar1P33896 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ifnar1P33896 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ifnar1P33896 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ifnar1P33896 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ifnar1P33896 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Ifnar1P33896 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ifnar1P33896 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ifnar1P33896 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ifnar1P33896 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ifnar1P33896 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Ifnar1P33896 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Ifnar1P33896 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ifnar1P33896 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ifnar1P33896 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ifnar1P33896 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ifnar1P33896 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ifnar1P33896 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ifnar1P33896 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ifnar1P33896 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms