Protein–RNA interactions for Protein: P31254

Uba1y, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 Y, mousemouse

Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1yP31254 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Uba1yP31254 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Uba1yP31254 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Uba1yP31254 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Uba1yP31254 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Uba1yP31254 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Uba1yP31254 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Uba1yP31254 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Uba1yP31254 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Uba1yP31254 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Uba1yP31254 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Uba1yP31254 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Uba1yP31254 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Uba1yP31254 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Uba1yP31254 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Uba1yP31254 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Uba1yP31254 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Uba1yP31254 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Uba1yP31254 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Uba1yP31254 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Uba1yP31254 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Uba1yP31254 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Uba1yP31254 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Uba1yP31254 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Uba1yP31254 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Uba1yP31254 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Uba1yP31254 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Uba1yP31254 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Uba1yP31254 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Uba1yP31254 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Uba1yP31254 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Uba1yP31254 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Uba1yP31254 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Uba1yP31254 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Uba1yP31254 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Uba1yP31254 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Uba1yP31254 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Uba1yP31254 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Uba1yP31254 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Uba1yP31254 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Uba1yP31254 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Uba1yP31254 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Uba1yP31254 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Uba1yP31254 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Uba1yP31254 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Uba1yP31254 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Uba1yP31254 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Uba1yP31254 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Uba1yP31254 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Uba1yP31254 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Uba1yP31254 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Uba1yP31254 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Uba1yP31254 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Uba1yP31254 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Uba1yP31254 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Uba1yP31254 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Uba1yP31254 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Uba1yP31254 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Uba1yP31254 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Uba1yP31254 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,53■■■□□ 2
Uba1yP31254 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Uba1yP31254 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Uba1yP31254 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Uba1yP31254 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Uba1yP31254 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Uba1yP31254 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Uba1yP31254 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Uba1yP31254 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Uba1yP31254 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,5 ms