Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Cdk4P30285 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Cdk4P30285 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cdk4P30285 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Cdk4P30285 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Cdk4P30285 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Cdk4P30285 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cdk4P30285 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Cdk4P30285 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cdk4P30285 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Cdk4P30285 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cdk4P30285 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Cdk4P30285 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cdk4P30285 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cdk4P30285 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cdk4P30285 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cdk4P30285 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Cdk4P30285 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Cdk4P30285 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cdk4P30285 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cdk4P30285 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Cdk4P30285 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cdk4P30285 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Cdk4P30285 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Cdk4P30285 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Cdk4P30285 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cdk4P30285 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cdk4P30285 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cdk4P30285 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cdk4P30285 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cdk4P30285 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cdk4P30285 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cdk4P30285 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cdk4P30285 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cdk4P30285 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cdk4P30285 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cdk4P30285 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cdk4P30285 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cdk4P30285 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cdk4P30285 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cdk4P30285 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Cdk4P30285 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cdk4P30285 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cdk4P30285 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cdk4P30285 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cdk4P30285 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cdk4P30285 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cdk4P30285 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cdk4P30285 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cdk4P30285 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cdk4P30285 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cdk4P30285 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cdk4P30285 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cdk4P30285 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cdk4P30285 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms