Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,61■■■■□ 3,77
Cnga1P29974 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Cnga1P29974 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Cnga1P29974 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cnga1P29974 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
Cnga1P29974 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Cnga1P29974 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Cnga1P29974 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Cnga1P29974 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,32■■■■□ 3,72
Cnga1P29974 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Cnga1P29974 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Cnga1P29974 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Cnga1P29974 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Cnga1P29974 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Cnga1P29974 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Cnga1P29974 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Cnga1P29974 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Cnga1P29974 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Cnga1P29974 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Cnga1P29974 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
Cnga1P29974 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Cnga1P29974 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Cnga1P29974 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Cnga1P29974 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Cnga1P29974 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Cnga1P29974 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Cnga1P29974 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Cnga1P29974 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Cnga1P29974 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Cnga1P29974 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cnga1P29974 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cnga1P29974 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Cnga1P29974 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,62■■■■□ 3,61
Cnga1P29974 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,6■■■■□ 3,61
Cnga1P29974 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cnga1P29974 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Cnga1P29974 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Cnga1P29974 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Cnga1P29974 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Cnga1P29974 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cnga1P29974 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cnga1P29974 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cnga1P29974 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Cnga1P29974 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Cnga1P29974 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Cnga1P29974 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Cnga1P29974 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,26■■■■□ 3,56
Cnga1P29974 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37,26■■■■□ 3,56
Cnga1P29974 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Cnga1P29974 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Cnga1P29974 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Cnga1P29974 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Cnga1P29974 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cnga1P29974 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Cnga1P29974 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Cnga1P29974 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Cnga1P29974 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Cnga1P29974 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Cnga1P29974 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cnga1P29974 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Cnga1P29974 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Cnga1P29974 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Cnga1P29974 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cnga1P29974 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cnga1P29974 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Cnga1P29974 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Cnga1P29974 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Cnga1P29974 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Cnga1P29974 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
Cnga1P29974 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Cnga1P29974 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Cnga1P29974 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,44■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,42
Cnga1P29974 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cnga1P29974 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,2 ms