Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Casp2P29594 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Casp2P29594 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Casp2P29594 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Casp2P29594 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Casp2P29594 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Casp2P29594 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Casp2P29594 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Casp2P29594 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Casp2P29594 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Casp2P29594 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Casp2P29594 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Casp2P29594 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Casp2P29594 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Casp2P29594 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Casp2P29594 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Casp2P29594 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Casp2P29594 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Casp2P29594 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Casp2P29594 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Casp2P29594 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Casp2P29594 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Casp2P29594 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Casp2P29594 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Casp2P29594 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Casp2P29594 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Casp2P29594 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Casp2P29594 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Casp2P29594 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Casp2P29594 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Casp2P29594 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Casp2P29594 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Casp2P29594 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Casp2P29594 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Casp2P29594 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Casp2P29594 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Casp2P29594 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Casp2P29594 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Casp2P29594 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Casp2P29594 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Casp2P29594 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Casp2P29594 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Casp2P29594 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Casp2P29594 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Casp2P29594 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Casp2P29594 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Casp2P29594 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Casp2P29594 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Casp2P29594 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Casp2P29594 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Casp2P29594 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Casp2P29594 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Casp2P29594 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Casp2P29594 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Casp2P29594 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Casp2P29594 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Casp2P29594 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Casp2P29594 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Casp2P29594 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Casp2P29594 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Casp2P29594 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Casp2P29594 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Casp2P29594 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Casp2P29594 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Casp2P29594 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Casp2P29594 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Casp2P29594 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Casp2P29594 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Casp2P29594 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Casp2P29594 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Casp2P29594 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Casp2P29594 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Casp2P29594 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Casp2P29594 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Casp2P29594 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Casp2P29594 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Casp2P29594 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,3 ms