Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gjb1P28230 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gjb1P28230 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gjb1P28230 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gjb1P28230 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gjb1P28230 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Gjb1P28230 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gjb1P28230 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gjb1P28230 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gjb1P28230 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gjb1P28230 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gjb1P28230 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gjb1P28230 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gjb1P28230 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gjb1P28230 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gjb1P28230 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gjb1P28230 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gjb1P28230 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Gjb1P28230 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gjb1P28230 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gjb1P28230 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gjb1P28230 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gjb1P28230 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gjb1P28230 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gjb1P28230 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gjb1P28230 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gjb1P28230 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gjb1P28230 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gjb1P28230 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gjb1P28230 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gjb1P28230 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gjb1P28230 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gjb1P28230 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gjb1P28230 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gjb1P28230 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gjb1P28230 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gjb1P28230 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gjb1P28230 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Gjb1P28230 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gjb1P28230 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gjb1P28230 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gjb1P28230 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gjb1P28230 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Gjb1P28230 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gjb1P28230 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gjb1P28230 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gjb1P28230 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gjb1P28230 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gjb1P28230 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gjb1P28230 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Gjb1P28230 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gjb1P28230 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gjb1P28230 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gjb1P28230 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gjb1P28230 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gjb1P28230 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gjb1P28230 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gjb1P28230 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gjb1P28230 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gjb1P28230 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gjb1P28230 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gjb1P28230 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gjb1P28230 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gjb1P28230 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Gjb1P28230 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gjb1P28230 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gjb1P28230 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gjb1P28230 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gjb1P28230 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Gjb1P28230 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gjb1P28230 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Gjb1P28230 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gjb1P28230 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gjb1P28230 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gjb1P28230 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Gjb1P28230 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gjb1P28230 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gjb1P28230 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gjb1P28230 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gjb1P28230 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gjb1P28230 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gjb1P28230 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gjb1P28230 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms