Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BrafP28028 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BrafP28028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BrafP28028 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BrafP28028 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BrafP28028 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BrafP28028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BrafP28028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BrafP28028 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BrafP28028 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BrafP28028 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BrafP28028 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BrafP28028 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BrafP28028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrafP28028 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrafP28028 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BrafP28028 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrafP28028 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BrafP28028 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BrafP28028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BrafP28028 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BrafP28028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BrafP28028 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrafP28028 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrafP28028 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BrafP28028 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BrafP28028 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BrafP28028 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BrafP28028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BrafP28028 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BrafP28028 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrafP28028 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrafP28028 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrafP28028 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BrafP28028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BrafP28028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BrafP28028 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BrafP28028 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BrafP28028 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrafP28028 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrafP28028 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BrafP28028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BrafP28028 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BrafP28028 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BrafP28028 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BrafP28028 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BrafP28028 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BrafP28028 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BrafP28028 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BrafP28028 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BrafP28028 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BrafP28028 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BrafP28028 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BrafP28028 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrafP28028 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BrafP28028 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrafP28028 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrafP28028 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BrafP28028 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BrafP28028 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BrafP28028 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BrafP28028 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BrafP28028 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BrafP28028 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BrafP28028 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BrafP28028 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BrafP28028 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BrafP28028 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BrafP28028 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BrafP28028 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BrafP28028 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BrafP28028 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrafP28028 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BrafP28028 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BrafP28028 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BrafP28028 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrafP28028 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrafP28028 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrafP28028 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrafP28028 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrafP28028 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BrafP28028 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BrafP28028 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BrafP28028 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BrafP28028 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrafP28028 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BrafP28028 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrafP28028 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BrafP28028 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BrafP28028 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrafP28028 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrafP28028 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BrafP28028 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrafP28028 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrafP28028 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BrafP28028 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrafP28028 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BrafP28028 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BrafP28028 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BrafP28028 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms