Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lef1P27782 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lef1P27782 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lef1P27782 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lef1P27782 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lef1P27782 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lef1P27782 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lef1P27782 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lef1P27782 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lef1P27782 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lef1P27782 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lef1P27782 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lef1P27782 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lef1P27782 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lef1P27782 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lef1P27782 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lef1P27782 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lef1P27782 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lef1P27782 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lef1P27782 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lef1P27782 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lef1P27782 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lef1P27782 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lef1P27782 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lef1P27782 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lef1P27782 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lef1P27782 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lef1P27782 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lef1P27782 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lef1P27782 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lef1P27782 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lef1P27782 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lef1P27782 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lef1P27782 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lef1P27782 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lef1P27782 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lef1P27782 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lef1P27782 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lef1P27782 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lef1P27782 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lef1P27782 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lef1P27782 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lef1P27782 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lef1P27782 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Lef1P27782 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lef1P27782 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lef1P27782 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lef1P27782 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lef1P27782 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lef1P27782 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lef1P27782 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lef1P27782 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lef1P27782 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lef1P27782 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lef1P27782 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lef1P27782 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lef1P27782 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms