Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rasgrf1P27671 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rasgrf1P27671 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasgrf1P27671 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasgrf1P27671 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasgrf1P27671 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasgrf1P27671 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasgrf1P27671 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasgrf1P27671 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasgrf1P27671 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasgrf1P27671 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasgrf1P27671 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasgrf1P27671 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasgrf1P27671 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrf1P27671 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrf1P27671 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasgrf1P27671 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasgrf1P27671 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasgrf1P27671 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rasgrf1P27671 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasgrf1P27671 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rasgrf1P27671 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrf1P27671 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrf1P27671 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rasgrf1P27671 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rasgrf1P27671 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rasgrf1P27671 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasgrf1P27671 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rasgrf1P27671 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rasgrf1P27671 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rasgrf1P27671 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasgrf1P27671 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasgrf1P27671 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasgrf1P27671 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rasgrf1P27671 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasgrf1P27671 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasgrf1P27671 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rasgrf1P27671 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasgrf1P27671 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasgrf1P27671 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasgrf1P27671 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasgrf1P27671 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasgrf1P27671 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasgrf1P27671 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasgrf1P27671 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasgrf1P27671 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasgrf1P27671 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rasgrf1P27671 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rasgrf1P27671 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rasgrf1P27671 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rasgrf1P27671 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rasgrf1P27671 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rasgrf1P27671 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rasgrf1P27671 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rasgrf1P27671 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rasgrf1P27671 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rasgrf1P27671 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rasgrf1P27671 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rasgrf1P27671 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rasgrf1P27671 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rasgrf1P27671 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rasgrf1P27671 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rasgrf1P27671 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rasgrf1P27671 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rasgrf1P27671 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rasgrf1P27671 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rasgrf1P27671 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rasgrf1P27671 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rasgrf1P27671 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms