Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd40lgP27548 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd40lgP27548 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd40lgP27548 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd40lgP27548 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd40lgP27548 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd40lgP27548 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd40lgP27548 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd40lgP27548 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd40lgP27548 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd40lgP27548 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd40lgP27548 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd40lgP27548 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd40lgP27548 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd40lgP27548 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd40lgP27548 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd40lgP27548 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd40lgP27548 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd40lgP27548 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd40lgP27548 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd40lgP27548 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd40lgP27548 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd40lgP27548 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd40lgP27548 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd40lgP27548 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd40lgP27548 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd40lgP27548 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd40lgP27548 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd40lgP27548 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd40lgP27548 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd40lgP27548 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd40lgP27548 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd40lgP27548 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd40lgP27548 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd40lgP27548 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd40lgP27548 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd40lgP27548 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd40lgP27548 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd40lgP27548 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd40lgP27548 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd40lgP27548 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd40lgP27548 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd40lgP27548 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd40lgP27548 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd40lgP27548 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd40lgP27548 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd40lgP27548 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms