Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Tgfb2P27090 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Tgfb2P27090 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Tgfb2P27090 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Tgfb2P27090 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Tgfb2P27090 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Tgfb2P27090 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Tgfb2P27090 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Tgfb2P27090 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Tgfb2P27090 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Tgfb2P27090 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Tgfb2P27090 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Tgfb2P27090 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Tgfb2P27090 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Tgfb2P27090 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Tgfb2P27090 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Tgfb2P27090 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Tgfb2P27090 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Tgfb2P27090 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Tgfb2P27090 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Tgfb2P27090 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Tgfb2P27090 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Tgfb2P27090 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Tgfb2P27090 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Tgfb2P27090 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Tgfb2P27090 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Tgfb2P27090 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Tgfb2P27090 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Tgfb2P27090 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Tgfb2P27090 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Tgfb2P27090 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Tgfb2P27090 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Tgfb2P27090 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Tgfb2P27090 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Tgfb2P27090 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Tgfb2P27090 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Tgfb2P27090 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Tgfb2P27090 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Tgfb2P27090 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Tgfb2P27090 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Tgfb2P27090 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Tgfb2P27090 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Tgfb2P27090 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Tgfb2P27090 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Tgfb2P27090 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Tgfb2P27090 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Tgfb2P27090 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Tgfb2P27090 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Tgfb2P27090 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Tgfb2P27090 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Tgfb2P27090 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Tgfb2P27090 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Tgfb2P27090 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Tgfb2P27090 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Tgfb2P27090 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Tgfb2P27090 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Tgfb2P27090 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Tgfb2P27090 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Tgfb2P27090 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Tgfb2P27090 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Tgfb2P27090 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Tgfb2P27090 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Tgfb2P27090 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,78■■■■□ 3
Tgfb2P27090 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Tgfb2P27090 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Tgfb2P27090 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Tgfb2P27090 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Tgfb2P27090 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tgfb2P27090 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tgfb2P27090 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tgfb2P27090 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Tgfb2P27090 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Tgfb2P27090 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,63■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Tgfb2P27090 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Tgfb2P27090 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Tgfb2P27090 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Tgfb2P27090 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Tgfb2P27090 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Tgfb2P27090 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Tgfb2P27090 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Tgfb2P27090 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Tgfb2P27090 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Tgfb2P27090 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Tgfb2P27090 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,9 ms