Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcmt1P23506 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcmt1P23506 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcmt1P23506 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcmt1P23506 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcmt1P23506 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pcmt1P23506 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcmt1P23506 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmt1P23506 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmt1P23506 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmt1P23506 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmt1P23506 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmt1P23506 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmt1P23506 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcmt1P23506 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmt1P23506 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcmt1P23506 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmt1P23506 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmt1P23506 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmt1P23506 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmt1P23506 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmt1P23506 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmt1P23506 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcmt1P23506 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmt1P23506 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmt1P23506 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcmt1P23506 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmt1P23506 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmt1P23506 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmt1P23506 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmt1P23506 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmt1P23506 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmt1P23506 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmt1P23506 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmt1P23506 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcmt1P23506 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcmt1P23506 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcmt1P23506 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcmt1P23506 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcmt1P23506 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcmt1P23506 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcmt1P23506 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcmt1P23506 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcmt1P23506 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcmt1P23506 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcmt1P23506 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcmt1P23506 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcmt1P23506 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcmt1P23506 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcmt1P23506 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcmt1P23506 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcmt1P23506 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcmt1P23506 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcmt1P23506 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcmt1P23506 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmt1P23506 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmt1P23506 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms