Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Pcmt1P23506 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Pcmt1P23506 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Pcmt1P23506 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Pcmt1P23506 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Pcmt1P23506 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Pcmt1P23506 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Pcmt1P23506 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Pcmt1P23506 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Pcmt1P23506 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Pcmt1P23506 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Pcmt1P23506 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Pcmt1P23506 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Pcmt1P23506 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Pcmt1P23506 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Pcmt1P23506 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Pcmt1P23506 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Pcmt1P23506 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Pcmt1P23506 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Pcmt1P23506 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pcmt1P23506 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pcmt1P23506 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Pcmt1P23506 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Pcmt1P23506 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Pcmt1P23506 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pcmt1P23506 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Pcmt1P23506 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Pcmt1P23506 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Pcmt1P23506 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Pcmt1P23506 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Pcmt1P23506 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Pcmt1P23506 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmt1P23506 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmt1P23506 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmt1P23506 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Pcmt1P23506 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Pcmt1P23506 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Pcmt1P23506 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Pcmt1P23506 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Pcmt1P23506 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Pcmt1P23506 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Pcmt1P23506 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Pcmt1P23506 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Pcmt1P23506 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,7■■□□□ 1,55
Pcmt1P23506 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Pcmt1P23506 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Pcmt1P23506 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Pcmt1P23506 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Pcmt1P23506 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Pcmt1P23506 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Pcmt1P23506 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Pcmt1P23506 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Pcmt1P23506 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Pcmt1P23506 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Pcmt1P23506 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Pcmt1P23506 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Pcmt1P23506 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Pcmt1P23506 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms