Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ggta1P23336 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ggta1P23336 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ggta1P23336 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Ggta1P23336 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ggta1P23336 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ggta1P23336 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ggta1P23336 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ggta1P23336 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ggta1P23336 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ggta1P23336 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ggta1P23336 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ggta1P23336 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ggta1P23336 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ggta1P23336 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ggta1P23336 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ggta1P23336 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ggta1P23336 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ggta1P23336 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ggta1P23336 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ggta1P23336 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ggta1P23336 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ggta1P23336 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ggta1P23336 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ggta1P23336 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ggta1P23336 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ggta1P23336 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ggta1P23336 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Ggta1P23336 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ggta1P23336 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ggta1P23336 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Ggta1P23336 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ggta1P23336 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ggta1P23336 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ggta1P23336 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ggta1P23336 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Ggta1P23336 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ggta1P23336 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ggta1P23336 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ggta1P23336 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ggta1P23336 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ggta1P23336 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ggta1P23336 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ggta1P23336 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ggta1P23336 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ggta1P23336 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Ggta1P23336 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ggta1P23336 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ggta1P23336 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ggta1P23336 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ggta1P23336 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ggta1P23336 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ggta1P23336 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ggta1P23336 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Ggta1P23336 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ggta1P23336 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ggta1P23336 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ggta1P23336 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ggta1P23336 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ggta1P23336 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Ggta1P23336 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ggta1P23336 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ggta1P23336 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ggta1P23336 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ggta1P23336 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ggta1P23336 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms