Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RargP18911 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RargP18911 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RargP18911 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RargP18911 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RargP18911 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RargP18911 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RargP18911 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RargP18911 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RargP18911 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RargP18911 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RargP18911 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RargP18911 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RargP18911 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RargP18911 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RargP18911 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RargP18911 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RargP18911 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RargP18911 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RargP18911 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RargP18911 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RargP18911 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RargP18911 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RargP18911 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RargP18911 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RargP18911 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RargP18911 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RargP18911 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RargP18911 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RargP18911 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RargP18911 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RargP18911 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RargP18911 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RargP18911 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RargP18911 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RargP18911 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RargP18911 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RargP18911 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RargP18911 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RargP18911 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RargP18911 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RargP18911 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RargP18911 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RargP18911 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RargP18911 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RargP18911 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RargP18911 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RargP18911 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RargP18911 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RargP18911 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RargP18911 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RargP18911 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RargP18911 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RargP18911 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RargP18911 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RargP18911 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RargP18911 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RargP18911 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RargP18911 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RargP18911 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RargP18911 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RargP18911 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RargP18911 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RargP18911 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RargP18911 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RargP18911 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RargP18911 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RargP18911 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RargP18911 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RargP18911 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RargP18911 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RargP18911 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RargP18911 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RargP18911 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RargP18911 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RargP18911 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RargP18911 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RargP18911 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RargP18911 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RargP18911 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RargP18911 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RargP18911 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RargP18911 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RargP18911 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RargP18911 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RargP18911 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RargP18911 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RargP18911 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RargP18911 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RargP18911 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RargP18911 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RargP18911 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RargP18911 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RargP18911 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RargP18911 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RargP18911 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RargP18911 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RargP18911 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RargP18911 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RargP18911 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms