Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
P18529 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
P18529 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P18529 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
P18529 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P18529 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,63■■□□□ 1,21
P18529 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
P18529 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
P18529 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,57■■□□□ 1,2
P18529 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
P18529 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
P18529 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
P18529 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,19
P18529 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
P18529 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,49■■□□□ 1,19
P18529 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
P18529 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
P18529 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
P18529 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
P18529 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
P18529 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
P18529 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
P18529 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
P18529 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
P18529 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P18529 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
P18529 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
P18529 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
P18529 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
P18529 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
P18529 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
P18529 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
P18529 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
P18529 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
P18529 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
P18529 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
P18529 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,17■■□□□ 1,14
P18529 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,17■■□□□ 1,14
P18529 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
P18529 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
P18529 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,12■■□□□ 1,13
P18529 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
P18529 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
P18529 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
P18529 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P18529 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
P18529 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
P18529 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
P18529 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
P18529 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
P18529 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
P18529 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
P18529 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
P18529 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
P18529 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
P18529 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
P18529 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
P18529 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
P18529 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P18529 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,1
P18529 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
P18529 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P18529 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
P18529 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
P18529 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P18529 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P18529 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
P18529 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
P18529 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
P18529 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
P18529 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
P18529 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
P18529 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
P18529 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
P18529 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,76■■□□□ 1,07
P18529 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
P18529 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
P18529 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
P18529 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,68■■□□□ 1,06
P18529 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P18529 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,65■■□□□ 1,06
P18529 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P18529 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,62■■□□□ 1,05
P18529 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
P18529 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
P18529 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
P18529 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
P18529 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P18529 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P18529 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P18529 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
P18529 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P18529 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P18529 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P18529 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P18529 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
P18529 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
P18529 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
P18529 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P18529 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms