Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxb1P17919 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb1P17919 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb1P17919 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb1P17919 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb1P17919 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb1P17919 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb1P17919 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb1P17919 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb1P17919 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb1P17919 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb1P17919 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxb1P17919 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb1P17919 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb1P17919 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb1P17919 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb1P17919 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb1P17919 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb1P17919 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb1P17919 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb1P17919 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb1P17919 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxb1P17919 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb1P17919 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb1P17919 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb1P17919 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb1P17919 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb1P17919 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb1P17919 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb1P17919 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb1P17919 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb1P17919 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb1P17919 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb1P17919 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb1P17919 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb1P17919 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb1P17919 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb1P17919 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb1P17919 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb1P17919 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb1P17919 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb1P17919 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb1P17919 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb1P17919 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms