Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LcatP16301 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LcatP16301 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LcatP16301 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LcatP16301 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LcatP16301 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LcatP16301 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LcatP16301 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LcatP16301 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LcatP16301 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LcatP16301 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LcatP16301 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LcatP16301 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LcatP16301 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LcatP16301 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LcatP16301 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LcatP16301 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LcatP16301 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LcatP16301 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LcatP16301 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LcatP16301 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LcatP16301 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LcatP16301 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LcatP16301 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LcatP16301 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LcatP16301 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LcatP16301 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LcatP16301 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LcatP16301 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LcatP16301 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LcatP16301 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LcatP16301 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LcatP16301 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LcatP16301 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LcatP16301 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LcatP16301 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LcatP16301 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LcatP16301 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LcatP16301 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LcatP16301 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LcatP16301 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LcatP16301 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LcatP16301 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LcatP16301 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LcatP16301 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LcatP16301 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LcatP16301 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LcatP16301 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LcatP16301 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LcatP16301 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LcatP16301 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LcatP16301 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LcatP16301 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LcatP16301 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LcatP16301 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LcatP16301 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LcatP16301 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LcatP16301 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LcatP16301 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LcatP16301 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LcatP16301 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LcatP16301 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LcatP16301 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LcatP16301 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LcatP16301 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LcatP16301 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LcatP16301 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LcatP16301 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LcatP16301 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LcatP16301 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LcatP16301 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LcatP16301 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LcatP16301 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LcatP16301 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LcatP16301 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LcatP16301 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LcatP16301 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LcatP16301 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LcatP16301 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LcatP16301 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LcatP16301 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LcatP16301 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LcatP16301 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LcatP16301 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LcatP16301 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LcatP16301 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LcatP16301 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LcatP16301 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LcatP16301 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LcatP16301 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LcatP16301 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LcatP16301 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LcatP16301 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LcatP16301 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LcatP16301 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LcatP16301 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LcatP16301 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LcatP16301 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LcatP16301 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LcatP16301 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms