Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RpsaP14206 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RpsaP14206 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RpsaP14206 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RpsaP14206 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RpsaP14206 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RpsaP14206 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RpsaP14206 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RpsaP14206 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RpsaP14206 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RpsaP14206 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RpsaP14206 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RpsaP14206 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RpsaP14206 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RpsaP14206 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RpsaP14206 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RpsaP14206 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RpsaP14206 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RpsaP14206 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RpsaP14206 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RpsaP14206 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RpsaP14206 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RpsaP14206 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RpsaP14206 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RpsaP14206 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RpsaP14206 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RpsaP14206 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RpsaP14206 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RpsaP14206 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RpsaP14206 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RpsaP14206 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RpsaP14206 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RpsaP14206 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RpsaP14206 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RpsaP14206 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RpsaP14206 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RpsaP14206 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RpsaP14206 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RpsaP14206 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RpsaP14206 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RpsaP14206 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpsaP14206 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RpsaP14206 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RpsaP14206 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RpsaP14206 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RpsaP14206 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RpsaP14206 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RpsaP14206 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RpsaP14206 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms