Protein–RNA interactions for Protein: P13707

Gpd1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpd1P13707 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpd1P13707 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpd1P13707 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpd1P13707 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpd1P13707 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpd1P13707 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpd1P13707 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpd1P13707 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpd1P13707 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpd1P13707 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpd1P13707 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpd1P13707 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpd1P13707 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpd1P13707 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpd1P13707 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpd1P13707 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpd1P13707 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpd1P13707 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpd1P13707 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpd1P13707 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpd1P13707 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpd1P13707 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpd1P13707 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpd1P13707 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpd1P13707 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpd1P13707 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpd1P13707 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpd1P13707 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpd1P13707 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpd1P13707 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpd1P13707 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gpd1P13707 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpd1P13707 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpd1P13707 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpd1P13707 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpd1P13707 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpd1P13707 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpd1P13707 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpd1P13707 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpd1P13707 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpd1P13707 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpd1P13707 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpd1P13707 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms