Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Il1r1P13504 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Il1r1P13504 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il1r1P13504 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Il1r1P13504 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il1r1P13504 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il1r1P13504 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il1r1P13504 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Il1r1P13504 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Il1r1P13504 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Il1r1P13504 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Il1r1P13504 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Il1r1P13504 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Il1r1P13504 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Il1r1P13504 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Il1r1P13504 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Il1r1P13504 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Il1r1P13504 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Il1r1P13504 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Il1r1P13504 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Il1r1P13504 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Il1r1P13504 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Il1r1P13504 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Il1r1P13504 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Il1r1P13504 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Il1r1P13504 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Il1r1P13504 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Il1r1P13504 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Il1r1P13504 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Il1r1P13504 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Il1r1P13504 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Il1r1P13504 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Il1r1P13504 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Il1r1P13504 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Il1r1P13504 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il1r1P13504 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il1r1P13504 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Il1r1P13504 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il1r1P13504 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Il1r1P13504 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Il1r1P13504 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Il1r1P13504 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il1r1P13504 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Il1r1P13504 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Il1r1P13504 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Il1r1P13504 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Il1r1P13504 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Il1r1P13504 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Il1r1P13504 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Il1r1P13504 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Il1r1P13504 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Il1r1P13504 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Il1r1P13504 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Il1r1P13504 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Il1r1P13504 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Il1r1P13504 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Il1r1P13504 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il1r1P13504 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il1r1P13504 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il1r1P13504 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Il1r1P13504 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms