Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vpreb1P13372 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vpreb1P13372 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vpreb1P13372 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vpreb1P13372 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vpreb1P13372 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vpreb1P13372 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vpreb1P13372 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb1P13372 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb1P13372 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vpreb1P13372 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vpreb1P13372 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vpreb1P13372 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vpreb1P13372 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vpreb1P13372 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb1P13372 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vpreb1P13372 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vpreb1P13372 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vpreb1P13372 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vpreb1P13372 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms