Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk1P11440 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk1P11440 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk1P11440 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk1P11440 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk1P11440 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk1P11440 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk1P11440 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk1P11440 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk1P11440 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk1P11440 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk1P11440 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk1P11440 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk1P11440 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk1P11440 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk1P11440 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk1P11440 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk1P11440 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk1P11440 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk1P11440 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk1P11440 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk1P11440 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk1P11440 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk1P11440 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk1P11440 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk1P11440 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk1P11440 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk1P11440 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk1P11440 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk1P11440 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk1P11440 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk1P11440 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk1P11440 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk1P11440 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk1P11440 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk1P11440 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk1P11440 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk1P11440 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk1P11440 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk1P11440 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk1P11440 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk1P11440 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk1P11440 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk1P11440 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk1P11440 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk1P11440 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk1P11440 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk1P11440 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk1P11440 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk1P11440 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk1P11440 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk1P11440 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk1P11440 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk1P11440 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk1P11440 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk1P11440 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk1P11440 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk1P11440 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms