Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PolP10400 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PolP10400 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PolP10400 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PolP10400 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PolP10400 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolP10400 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolP10400 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PolP10400 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolP10400 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PolP10400 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PolP10400 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolP10400 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolP10400 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolP10400 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolP10400 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolP10400 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolP10400 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PolP10400 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolP10400 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolP10400 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PolP10400 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PolP10400 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP10400 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP10400 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP10400 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP10400 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP10400 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP10400 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP10400 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP10400 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP10400 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP10400 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP10400 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP10400 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP10400 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP10400 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP10400 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP10400 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP10400 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP10400 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP10400 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP10400 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP10400 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP10400 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP10400 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PolP10400 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PolP10400 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PolP10400 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PolP10400 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PolP10400 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PolP10400 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolP10400 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolP10400 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolP10400 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolP10400 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolP10400 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolP10400 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolP10400 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolP10400 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolP10400 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolP10400 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolP10400 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PolP10400 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PolP10400 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PolP10400 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PolP10400 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PolP10400 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PolP10400 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PolP10400 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PolP10400 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PolP10400 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PolP10400 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PolP10400 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PolP10400 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PolP10400 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PolP10400 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolP10400 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP10400 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP10400 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP10400 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP10400 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP10400 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP10400 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP10400 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP10400 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP10400 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP10400 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP10400 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP10400 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP10400 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP10400 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP10400 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP10400 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP10400 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP10400 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP10400 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP10400 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP10400 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP10400 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms