Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem254aP0DN89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem254aP0DN89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem254aP0DN89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem254aP0DN89 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem254aP0DN89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem254aP0DN89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem254aP0DN89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem254aP0DN89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem254aP0DN89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem254aP0DN89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem254aP0DN89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem254aP0DN89 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem254aP0DN89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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