Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Becn2P0DM65 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Becn2P0DM65 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Becn2P0DM65 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Becn2P0DM65 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Becn2P0DM65 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Becn2P0DM65 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Becn2P0DM65 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Becn2P0DM65 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Becn2P0DM65 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Becn2P0DM65 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Becn2P0DM65 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Becn2P0DM65 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Becn2P0DM65 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Becn2P0DM65 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Becn2P0DM65 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Becn2P0DM65 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Becn2P0DM65 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Becn2P0DM65 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Becn2P0DM65 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Becn2P0DM65 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Becn2P0DM65 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Becn2P0DM65 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Becn2P0DM65 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Becn2P0DM65 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Becn2P0DM65 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Becn2P0DM65 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Becn2P0DM65 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Becn2P0DM65 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Becn2P0DM65 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Becn2P0DM65 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Becn2P0DM65 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Becn2P0DM65 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Becn2P0DM65 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Becn2P0DM65 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Becn2P0DM65 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Becn2P0DM65 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Becn2P0DM65 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Becn2P0DM65 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Becn2P0DM65 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Becn2P0DM65 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Becn2P0DM65 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Becn2P0DM65 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Becn2P0DM65 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Becn2P0DM65 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Becn2P0DM65 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Becn2P0DM65 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Becn2P0DM65 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Becn2P0DM65 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Becn2P0DM65 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Becn2P0DM65 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Becn2P0DM65 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Becn2P0DM65 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Becn2P0DM65 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Becn2P0DM65 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Becn2P0DM65 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms