Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprqP0C5E4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprqP0C5E4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprqP0C5E4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprqP0C5E4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprqP0C5E4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprqP0C5E4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprqP0C5E4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprqP0C5E4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprqP0C5E4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprqP0C5E4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprqP0C5E4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprqP0C5E4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprqP0C5E4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprqP0C5E4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprqP0C5E4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprqP0C5E4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprqP0C5E4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprqP0C5E4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprqP0C5E4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprqP0C5E4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprqP0C5E4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprqP0C5E4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprqP0C5E4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprqP0C5E4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprqP0C5E4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprqP0C5E4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprqP0C5E4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprqP0C5E4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprqP0C5E4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprqP0C5E4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprqP0C5E4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprqP0C5E4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprqP0C5E4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprqP0C5E4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprqP0C5E4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprqP0C5E4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprqP0C5E4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprqP0C5E4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms