Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Hoxb2P0C1T1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Hoxb2P0C1T1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Hoxb2P0C1T1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Hoxb2P0C1T1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Hoxb2P0C1T1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Hoxb2P0C1T1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Hoxb2P0C1T1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Hoxb2P0C1T1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Hoxb2P0C1T1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Hoxb2P0C1T1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Hoxb2P0C1T1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Hoxb2P0C1T1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Hoxb2P0C1T1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Hoxb2P0C1T1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Hoxb2P0C1T1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Hoxb2P0C1T1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Hoxb2P0C1T1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Hoxb2P0C1T1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Hoxb2P0C1T1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Hoxb2P0C1T1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Hoxb2P0C1T1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Hoxb2P0C1T1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Hoxb2P0C1T1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Hoxb2P0C1T1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Hoxb2P0C1T1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,42
Hoxb2P0C1T1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Hoxb2P0C1T1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Hoxb2P0C1T1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Hoxb2P0C1T1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Hoxb2P0C1T1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Hoxb2P0C1T1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Hoxb2P0C1T1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Hoxb2P0C1T1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Hoxb2P0C1T1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Hoxb2P0C1T1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Hoxb2P0C1T1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Hoxb2P0C1T1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Hoxb2P0C1T1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Hoxb2P0C1T1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Hoxb2P0C1T1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Hoxb2P0C1T1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Hoxb2P0C1T1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Hoxb2P0C1T1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Hoxb2P0C1T1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Hoxb2P0C1T1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Hoxb2P0C1T1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Hoxb2P0C1T1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Hoxb2P0C1T1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Hoxb2P0C1T1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Hoxb2P0C1T1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Hoxb2P0C1T1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Hoxb2P0C1T1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hoxb2P0C1T1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hoxb2P0C1T1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Hoxb2P0C1T1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Hoxb2P0C1T1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms