Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxb8P09632 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxb8P09632 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxb8P09632 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxb8P09632 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxb8P09632 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxb8P09632 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxb8P09632 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxb8P09632 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxb8P09632 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxb8P09632 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxb8P09632 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxb8P09632 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxb8P09632 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxb8P09632 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxb8P09632 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxb8P09632 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxb8P09632 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxb8P09632 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxb8P09632 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxb8P09632 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxb8P09632 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxb8P09632 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxb8P09632 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxb8P09632 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxb8P09632 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxb8P09632 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxb8P09632 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxb8P09632 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxb8P09632 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxb8P09632 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxb8P09632 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxb8P09632 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxb8P09632 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxb8P09632 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxb8P09632 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxb8P09632 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxb8P09632 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxb8P09632 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxb8P09632 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxb8P09632 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxb8P09632 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxb8P09632 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxb8P09632 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxb8P09632 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxb8P09632 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxb8P09632 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxb8P09632 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxb8P09632 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxb8P09632 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxb8P09632 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxb8P09632 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hoxb8P09632 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxb8P09632 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxb8P09632 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxb8P09632 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxb8P09632 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxb8P09632 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxb8P09632 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxb8P09632 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxb8P09632 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxb8P09632 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxb8P09632 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxb8P09632 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxb8P09632 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb8P09632 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxb8P09632 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxb8P09632 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb8P09632 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxb8P09632 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxb8P09632 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb8P09632 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb8P09632 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxb8P09632 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb8P09632 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxb8P09632 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb8P09632 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxb8P09632 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb8P09632 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms