Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ifna9P09235 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ifna9P09235 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ifna9P09235 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ifna9P09235 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ifna9P09235 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ifna9P09235 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ifna9P09235 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ifna9P09235 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna9P09235 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna9P09235 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna9P09235 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ifna9P09235 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ifna9P09235 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ifna9P09235 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ifna9P09235 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ifna9P09235 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Ifna9P09235 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ifna9P09235 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ifna9P09235 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ifna9P09235 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ifna9P09235 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ifna9P09235 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ifna9P09235 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ifna9P09235 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ifna9P09235 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Ifna9P09235 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ifna9P09235 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ifna9P09235 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ifna9P09235 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ifna9P09235 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ifna9P09235 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ifna9P09235 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Ifna9P09235 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna9P09235 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Ifna9P09235 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ifna9P09235 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ifna9P09235 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ifna9P09235 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ifna9P09235 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ifna9P09235 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ifna9P09235 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,48■■□□□ 1,19
Ifna9P09235 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ifna9P09235 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ifna9P09235 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ifna9P09235 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ifna9P09235 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ifna9P09235 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ifna9P09235 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ifna9P09235 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ifna9P09235 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ifna9P09235 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Ifna9P09235 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ifna9P09235 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ifna9P09235 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ifna9P09235 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ifna9P09235 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ifna9P09235 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ifna9P09235 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms