Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
P06330 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
P06330 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
P06330 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,69■□□□□ 0,9
P06330 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
P06330 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
P06330 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
P06330 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
P06330 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
P06330 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,6■□□□□ 0,89
P06330 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
P06330 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
P06330 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,58■□□□□ 0,89
P06330 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
P06330 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
P06330 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
P06330 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
P06330 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
P06330 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,52■□□□□ 0,88
P06330 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
P06330 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
P06330 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
P06330 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
P06330 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
P06330 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
P06330 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
P06330 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20,41■□□□□ 0,86
P06330 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
P06330 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,39■□□□□ 0,85
P06330 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
P06330 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
P06330 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
P06330 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,35■□□□□ 0,85
P06330 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
P06330 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
P06330 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
P06330 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
P06330 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
P06330 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
P06330 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
P06330 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
P06330 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
P06330 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P06330 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P06330 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P06330 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P06330 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P06330 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
P06330 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
P06330 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
P06330 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
P06330 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P06330 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P06330 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,12■□□□□ 0,81
P06330 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
P06330 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,1■□□□□ 0,81
P06330 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,08■□□□□ 0,81
P06330 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,08■□□□□ 0,8
P06330 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
P06330 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P06330 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,06■□□□□ 0,8
P06330 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,05■□□□□ 0,8
P06330 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,03■□□□□ 0,8
P06330 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P06330 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
P06330 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
P06330 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19,97■□□□□ 0,79
P06330 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19,97■□□□□ 0,79
P06330 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
P06330 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
P06330 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
P06330 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
P06330 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
P06330 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
P06330 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
P06330 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
P06330 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
P06330 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
P06330 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
P06330 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
P06330 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
P06330 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
P06330 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
P06330 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
P06330 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
P06330 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
P06330 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
P06330 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,79■□□□□ 0,76
P06330 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19,78■□□□□ 0,76
P06330 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19,78■□□□□ 0,76
P06330 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P06330 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P06330 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
P06330 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
P06330 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
P06330 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
P06330 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
P06330 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
P06330 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
P06330 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms