Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Hoxa7P02830 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxa7P02830 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxa7P02830 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hoxa7P02830 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hoxa7P02830 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hoxa7P02830 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Hoxa7P02830 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxa7P02830 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxa7P02830 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxa7P02830 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxa7P02830 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxa7P02830 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hoxa7P02830 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Hoxa7P02830 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hoxa7P02830 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Hoxa7P02830 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hoxa7P02830 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Hoxa7P02830 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxa7P02830 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxa7P02830 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hoxa7P02830 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hoxa7P02830 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxa7P02830 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxa7P02830 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hoxa7P02830 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hoxa7P02830 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Hoxa7P02830 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxa7P02830 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hoxa7P02830 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxa7P02830 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hoxa7P02830 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxa7P02830 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxa7P02830 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxa7P02830 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxa7P02830 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxa7P02830 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxa7P02830 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hoxa7P02830 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hoxa7P02830 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hoxa7P02830 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hoxa7P02830 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hoxa7P02830 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Hoxa7P02830 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hoxa7P02830 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hoxa7P02830 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxa7P02830 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxa7P02830 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxa7P02830 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxa7P02830 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxa7P02830 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxa7P02830 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxa7P02830 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxa7P02830 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxa7P02830 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxa7P02830 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxa7P02830 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxa7P02830 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxa7P02830 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxa7P02830 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxa7P02830 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxa7P02830 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxa7P02830 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Hoxa7P02830 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxa7P02830 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hoxa7P02830 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hoxa7P02830 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxa7P02830 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxa7P02830 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxa7P02830 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxa7P02830 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hoxa7P02830 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hoxa7P02830 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Hoxa7P02830 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Hoxa7P02830 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hoxa7P02830 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms