Protein–RNA interactions for Protein: P01863

Ighg, Ig gamma-2A chain C region, A allele, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghgP01863 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IghgP01863 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IghgP01863 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IghgP01863 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IghgP01863 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IghgP01863 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IghgP01863 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IghgP01863 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IghgP01863 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IghgP01863 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IghgP01863 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IghgP01863 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IghgP01863 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IghgP01863 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IghgP01863 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IghgP01863 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IghgP01863 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IghgP01863 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IghgP01863 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IghgP01863 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IghgP01863 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IghgP01863 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IghgP01863 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IghgP01863 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IghgP01863 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IghgP01863 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IghgP01863 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IghgP01863 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IghgP01863 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IghgP01863 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IghgP01863 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IghgP01863 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IghgP01863 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IghgP01863 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IghgP01863 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IghgP01863 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IghgP01863 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IghgP01863 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IghgP01863 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IghgP01863 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IghgP01863 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IghgP01863 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IghgP01863 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IghgP01863 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IghgP01863 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IghgP01863 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IghgP01863 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IghgP01863 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IghgP01863 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IghgP01863 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IghgP01863 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IghgP01863 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IghgP01863 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IghgP01863 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IghgP01863 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IghgP01863 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IghgP01863 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IghgP01863 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IghgP01863 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IghgP01863 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IghgP01863 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IghgP01863 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IghgP01863 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IghgP01863 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IghgP01863 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IghgP01863 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IghgP01863 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IghgP01863 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IghgP01863 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IghgP01863 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IghgP01863 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IghgP01863 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IghgP01863 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IghgP01863 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IghgP01863 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IghgP01863 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IghgP01863 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IghgP01863 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IghgP01863 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IghgP01863 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IghgP01863 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IghgP01863 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IghgP01863 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IghgP01863 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IghgP01863 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IghgP01863 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IghgP01863 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IghgP01863 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IghgP01863 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IghgP01863 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IghgP01863 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IghgP01863 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IghgP01863 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IghgP01863 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IghgP01863 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IghgP01863 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IghgP01863 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IghgP01863 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IghgP01863 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IghgP01863 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms