Protein–RNA interactions for Protein: P01845

Iglc3, Ig lambda-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglc3P01845 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Iglc3P01845 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iglc3P01845 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iglc3P01845 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iglc3P01845 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Iglc3P01845 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Iglc3P01845 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Iglc3P01845 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Iglc3P01845 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iglc3P01845 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iglc3P01845 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iglc3P01845 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iglc3P01845 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Iglc3P01845 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Iglc3P01845 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iglc3P01845 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iglc3P01845 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Iglc3P01845 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Iglc3P01845 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Iglc3P01845 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iglc3P01845 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Iglc3P01845 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iglc3P01845 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iglc3P01845 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iglc3P01845 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iglc3P01845 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Iglc3P01845 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iglc3P01845 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iglc3P01845 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iglc3P01845 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Iglc3P01845 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Iglc3P01845 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iglc3P01845 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Iglc3P01845 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Iglc3P01845 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iglc3P01845 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iglc3P01845 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Iglc3P01845 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iglc3P01845 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Iglc3P01845 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iglc3P01845 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iglc3P01845 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iglc3P01845 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms