Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,01■□□□□ 0,47
P01819 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
P01819 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
P01819 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
P01819 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
P01819 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
P01819 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
P01819 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
P01819 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
P01819 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
P01819 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
P01819 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
P01819 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
P01819 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17,83■□□□□ 0,44
P01819 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
P01819 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
P01819 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
P01819 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17,8■□□□□ 0,44
P01819 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
P01819 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
P01819 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17,73■□□□□ 0,43
P01819 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,72■□□□□ 0,43
P01819 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
P01819 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
P01819 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
P01819 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
P01819 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
P01819 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
P01819 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,66■□□□□ 0,42
P01819 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
P01819 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
P01819 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17,64■□□□□ 0,41
P01819 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17,63■□□□□ 0,41
P01819 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
P01819 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
P01819 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
P01819 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
P01819 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
P01819 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,41
P01819 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
P01819 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17,56■□□□□ 0,4
P01819 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
P01819 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17,54■□□□□ 0,4
P01819 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17,53■□□□□ 0,4
P01819 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
P01819 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
P01819 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
P01819 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17,48■□□□□ 0,39
P01819 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
P01819 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
P01819 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17,46■□□□□ 0,39
P01819 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17,43■□□□□ 0,38
P01819 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
P01819 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
P01819 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17,37■□□□□ 0,37
P01819 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
P01819 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
P01819 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
P01819 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
P01819 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
P01819 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
P01819 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17,3■□□□□ 0,36
P01819 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17,29■□□□□ 0,36
P01819 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17,28■□□□□ 0,36
P01819 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
P01819 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
P01819 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01819 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01819 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01819 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
P01819 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
P01819 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01819 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01819 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
P01819 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
P01819 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
P01819 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P01819 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,21■□□□□ 0,35
P01819 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01819 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01819 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01819 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01819 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01819 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01819 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01819 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01819 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01819 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17,17■□□□□ 0,34
P01819 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
P01819 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
P01819 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
P01819 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17,12■□□□□ 0,33
P01819 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01819 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01819 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01819 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17,1■□□□□ 0,33
P01819 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01819 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01819 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17,08■□□□□ 0,32
P01819 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms