Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifna1P01572 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifna1P01572 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifna1P01572 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifna1P01572 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifna1P01572 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifna1P01572 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifna1P01572 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifna1P01572 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifna1P01572 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifna1P01572 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifna1P01572 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifna1P01572 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifna1P01572 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifna1P01572 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifna1P01572 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifna1P01572 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifna1P01572 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifna1P01572 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifna1P01572 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifna1P01572 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifna1P01572 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna1P01572 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna1P01572 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna1P01572 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifna1P01572 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna1P01572 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifna1P01572 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifna1P01572 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifna1P01572 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna1P01572 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifna1P01572 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifna1P01572 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifna1P01572 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifna1P01572 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna1P01572 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifna1P01572 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna1P01572 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna1P01572 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifna1P01572 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna1P01572 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifna1P01572 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifna1P01572 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna1P01572 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna1P01572 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms