Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Setdb1O88974 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Setdb1O88974 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Setdb1O88974 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Setdb1O88974 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Setdb1O88974 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Setdb1O88974 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Setdb1O88974 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,51■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Setdb1O88974 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Setdb1O88974 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Setdb1O88974 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Setdb1O88974 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Setdb1O88974 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Setdb1O88974 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Setdb1O88974 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Setdb1O88974 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Setdb1O88974 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Setdb1O88974 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Setdb1O88974 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Setdb1O88974 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Setdb1O88974 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Setdb1O88974 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Setdb1O88974 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Setdb1O88974 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Setdb1O88974 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Setdb1O88974 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Setdb1O88974 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Setdb1O88974 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Setdb1O88974 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Setdb1O88974 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Setdb1O88974 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Setdb1O88974 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Setdb1O88974 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Setdb1O88974 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Setdb1O88974 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Setdb1O88974 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Setdb1O88974 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Setdb1O88974 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Setdb1O88974 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Setdb1O88974 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Setdb1O88974 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Setdb1O88974 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Setdb1O88974 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Setdb1O88974 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Setdb1O88974 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Setdb1O88974 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Setdb1O88974 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Setdb1O88974 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Setdb1O88974 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Setdb1O88974 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Setdb1O88974 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Setdb1O88974 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Setdb1O88974 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Setdb1O88974 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Setdb1O88974 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Setdb1O88974 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Setdb1O88974 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Setdb1O88974 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Setdb1O88974 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Setdb1O88974 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Setdb1O88974 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Setdb1O88974 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Setdb1O88974 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Setdb1O88974 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Setdb1O88974 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Setdb1O88974 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Setdb1O88974 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Setdb1O88974 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
Setdb1O88974 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Setdb1O88974 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Setdb1O88974 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,01■■■□□ 2,88
Setdb1O88974 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Setdb1O88974 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Setdb1O88974 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Setdb1O88974 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Setdb1O88974 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,3 ms