Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
Dll3O88516 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Dll3O88516 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Dll3O88516 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Dll3O88516 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Dll3O88516 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Dll3O88516 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Dll3O88516 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Dll3O88516 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Dll3O88516 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Dll3O88516 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Dll3O88516 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Dll3O88516 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Dll3O88516 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Dll3O88516 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Dll3O88516 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Dll3O88516 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Dll3O88516 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Dll3O88516 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Dll3O88516 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Dll3O88516 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Dll3O88516 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Dll3O88516 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Dll3O88516 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Dll3O88516 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Dll3O88516 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Dll3O88516 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Dll3O88516 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Dll3O88516 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Dll3O88516 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Dll3O88516 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Dll3O88516 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Dll3O88516 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Dll3O88516 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Dll3O88516 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Dll3O88516 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Dll3O88516 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Dll3O88516 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Dll3O88516 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Dll3O88516 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Dll3O88516 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Dll3O88516 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Dll3O88516 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Dll3O88516 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Dll3O88516 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Dll3O88516 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Dll3O88516 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Dll3O88516 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Dll3O88516 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Dll3O88516 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Dll3O88516 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Dll3O88516 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Dll3O88516 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Dll3O88516 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Dll3O88516 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Dll3O88516 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Dll3O88516 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Dll3O88516 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Dll3O88516 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Dll3O88516 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Dll3O88516 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Dll3O88516 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Dll3O88516 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Dll3O88516 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Dll3O88516 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Dll3O88516 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Dll3O88516 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Dll3O88516 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Dll3O88516 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Dll3O88516 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Dll3O88516 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Dll3O88516 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Dll3O88516 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Dll3O88516 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Dll3O88516 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Dll3O88516 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Dll3O88516 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Dll3O88516 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Dll3O88516 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Dll3O88516 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Dll3O88516 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Dll3O88516 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Dll3O88516 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Dll3O88516 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Dll3O88516 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Dll3O88516 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Dll3O88516 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Dll3O88516 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms