Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ctnnal1O88327 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ctnnal1O88327 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ctnnal1O88327 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ctnnal1O88327 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctnnal1O88327 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctnnal1O88327 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctnnal1O88327 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ctnnal1O88327 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ctnnal1O88327 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ctnnal1O88327 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ctnnal1O88327 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ctnnal1O88327 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ctnnal1O88327 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ctnnal1O88327 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ctnnal1O88327 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctnnal1O88327 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ctnnal1O88327 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctnnal1O88327 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctnnal1O88327 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctnnal1O88327 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctnnal1O88327 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ctnnal1O88327 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctnnal1O88327 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctnnal1O88327 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctnnal1O88327 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ctnnal1O88327 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctnnal1O88327 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctnnal1O88327 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ctnnal1O88327 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctnnal1O88327 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctnnal1O88327 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctnnal1O88327 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ctnnal1O88327 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctnnal1O88327 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctnnal1O88327 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctnnal1O88327 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ctnnal1O88327 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ctnnal1O88327 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctnnal1O88327 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctnnal1O88327 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnnal1O88327 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnnal1O88327 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctnnal1O88327 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctnnal1O88327 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctnnal1O88327 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctnnal1O88327 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctnnal1O88327 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctnnal1O88327 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctnnal1O88327 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctnnal1O88327 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctnnal1O88327 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctnnal1O88327 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnnal1O88327 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnnal1O88327 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctnnal1O88327 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctnnal1O88327 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctnnal1O88327 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctnnal1O88327 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctnnal1O88327 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctnnal1O88327 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctnnal1O88327 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ctnnal1O88327 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctnnal1O88327 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctnnal1O88327 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctnnal1O88327 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ctnnal1O88327 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ctnnal1O88327 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctnnal1O88327 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctnnal1O88327 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctnnal1O88327 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctnnal1O88327 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnnal1O88327 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctnnal1O88327 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ctnnal1O88327 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctnnal1O88327 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnnal1O88327 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnnal1O88327 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnnal1O88327 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnal1O88327 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnnal1O88327 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctnnal1O88327 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctnnal1O88327 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctnnal1O88327 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctnnal1O88327 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctnnal1O88327 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctnnal1O88327 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms