Protein–RNA interactions for Protein: O88273

Grem2, Gremlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grem2O88273 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grem2O88273 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Grem2O88273 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grem2O88273 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grem2O88273 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grem2O88273 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Grem2O88273 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grem2O88273 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grem2O88273 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Grem2O88273 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grem2O88273 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grem2O88273 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grem2O88273 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Grem2O88273 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Grem2O88273 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Grem2O88273 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Grem2O88273 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Grem2O88273 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Grem2O88273 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Grem2O88273 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Grem2O88273 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Grem2O88273 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grem2O88273 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grem2O88273 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grem2O88273 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Grem2O88273 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Grem2O88273 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grem2O88273 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grem2O88273 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grem2O88273 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grem2O88273 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grem2O88273 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grem2O88273 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grem2O88273 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Grem2O88273 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grem2O88273 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Grem2O88273 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Grem2O88273 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Grem2O88273 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Grem2O88273 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Grem2O88273 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grem2O88273 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grem2O88273 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grem2O88273 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grem2O88273 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grem2O88273 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grem2O88273 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Grem2O88273 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grem2O88273 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grem2O88273 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grem2O88273 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Grem2O88273 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Grem2O88273 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Grem2O88273 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Grem2O88273 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Grem2O88273 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Grem2O88273 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Grem2O88273 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Grem2O88273 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Grem2O88273 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grem2O88273 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grem2O88273 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Grem2O88273 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grem2O88273 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grem2O88273 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grem2O88273 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grem2O88273 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Grem2O88273 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Grem2O88273 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Grem2O88273 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Grem2O88273 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Grem2O88273 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Grem2O88273 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Grem2O88273 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Grem2O88273 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grem2O88273 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grem2O88273 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grem2O88273 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grem2O88273 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Grem2O88273 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grem2O88273 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms